The Theory of Everything baseert zich op de memoires van Jane Hawking. Het is 1963 als Stephen Hawking (Eddie Redmayne) en Jane Wilde (Felicity Jones) elkaar ontmoeten op een studentenfeestje in Cambridge. Tussen Hawking, die later een befaamd natuurkundige zal worden en de Letterenstudente Jane bloeit al snel een relatie op. Niet lang daarna neemt Hawkings leven een drastische wending als hij naar aanleiding van een val wordt opgenomen in het ziekenhuis. Onderzoek wijst uit dat Hawking waarschijnlijk nog maar twee jaar zal leven. En wat is nu twee jaar als je promotieonderzoek zich richt op de grenzeloosheid van tijd?